O Brasil ainda tem índios isolados, sem contato com a civilização?

Sim, e o número é expressivo. O Brasil tem o maior número de povos isolados, ainda não contactados, em todo o mundo.
Segundo informações da Funai, de 2007, existiam nesse ano, em todo o país, 67 tribos indígenas não contactadas, das quais 32 estavam confirmadas. Era um número superior ao da Nova Guiné, até então considerada a nação com o maior número de tribos isoladas. No entanto, não são conhecidos os números atuais da Nova Guiné.
Esses números sobre as tribos isoladas no Brasil ainda não são totalmente confiáveis. Enquanto a Funai fala em 67 ou 69 povos isolados, o Conselho Indigenista Missionário (CIMI) aponta a existência de 98.
As tribos isoladas do Brasil, em 2013, contavam com um total estimado em 10 mil pessoas.
Veja quais são as reservas indígenas brasileiras onde atualmente vivem exclusivamente índios isolados, que ainda não tiveram contato com a civilização:
- Acre: várias tribos na Terra Indígena Alto Tarauacá, Terra Indígena Riozinho do Alto Envira, Terra Indigena Xinane Isolados e Terra Indígena Igarapé Taboca do Alto Tarauacá.
- Amazonas: Terra Indígena Hi Merimã, Terra Indígena Jacareúba/Katawixi e Terra Indígena Kawahiva do Rio Pardo (esta também ocupando parte do estado do Mato Grosso).
- Rondônia: Terra Indígena Massaco, Terra Indígena Rio Omerê, Terra Indígena Rio Muqui e Terra Indígena Tanaru (onde estaria vivendo apenas um Índio Tanaru, pois os demais foram massacrados ou morreram por diversas doenças).
Em outras terras indígenas também existem índios isolados mas, ao mesmo tempo, também há tribos que já tiveram contato com a civilização. Essas áreas mistas estão localizadas no Maranhão, Amazonas, Goiás (onde os índios Avá-Canoeiros são os mais conhecidos; vivem perambulando na região da Mata do Mamão, na Ilha do Bananal e correm o risco de desaparecer), Mato Grosso, Rondônia, Tocantins, Pará, Acre e Roraima.
O maior grupo conhecido de índios isolados é formado por cerca de 1.500 indivíduos da nação Hi-Merimã, que vive no médio Rio Piranha e Rio Riozinho, na Bacia do Rio Purus, no Amazonas. Essa área foi declarada recentemente como protegida.